绕过比对迷宫 新算法揭秘多倍体基因组

  近日，中国农业科学院农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队开发出多倍体基因组关联分析新方法，攻克了多倍体复杂基因组遗传分析难题。相关研究成果发表在《自然・遗传学（Nature Genetics）》上。

  多倍体基因组包含多套高度相似的同源染色体组，传统全基因组关联分析需先将测序片段与参考基因组精确比对后鉴定个体基因型。然而，由于多倍体基因组的同源染色体高度相似，片段经常定位错误，造成分析结果失真。

  为了解决该问题，科研团队跳出传统思路，提出一种不依赖参考序列比对的多倍体全基因组关联分析新方法，通过“数”基因片段，绕过繁琐的拼接环节，来寻找与性状相关的关键基因。该方法已经成功在二倍体水稻、四倍体苜蓿、六倍体甘薯、多倍体栽培甘蔗验证可行，并在复杂的野生甘蔗群体中找到了控制糖分积累和分蘖的关键基因。该研究为多倍体作物精准设计育种提供了强有力的工具，有望加速优良品种培育进程。

  该研究得到国家自然科学基金、中国农业科学院科技创新工程等项目支持。（宋雅娟）

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